La Disparition de Haruhi Suzumiya

L'histoire commence environ un mois après le festival culturel. Le 16 décembre, date à laquelle commence le film, on apprend que la brigade SOS a décidé d'organiser dans une nouvelle soirée spéciale en l'honneur de la nativité. Le jour suivant, la brigade SOS commence tranquillement à décorer la salle du club en vue du réveillon de Noël. Mais, alors que tout allait pour le mieux, le matin du 18 décembre, Kyon se réveille dans un monde où Haruhi Suzumiya ne semble avoir jamais existé tandis que d'autres personnes qui ne devraient pas être là, le sont.