Synopsis

En l'an 2194, des êtres mystérieux venus de l'espace, connus sous le nom Gamilons, apparaissent et attaquent la Terre avec des bombes météorites, tuant ainsi de nombreux habitants.

Cinq ans plus tard, en 2199, la Terre est de plus en plus contaminée par les radiations des bombes météores. Les derniers survivants se réfugient sous terre. Susumu Kodai, ancien pilote maintenant à la retraite, tombe un jour sur une capsule de la planète Iscandar, qui réside à 148 000 années-lumière de la Terre. Via cette capsule, un message est donné. Celui-ci parle de l'existence d'une substance permettant de nettoyer la Terre de la radioactivité. Pour la récupérer à Iscandar, un équipage est préparé. Avec cette mission, une grande bataille commence...